Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAPVD1Q14C86 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms