Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KCNAB1Q14722 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNAB1Q14722 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNAB1Q14722 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNAB1Q14722 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNAB1Q14722 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNAB1Q14722 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNAB1Q14722 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNAB1Q14722 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNAB1Q14722 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNAB1Q14722 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms