Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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