Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NBR1Q14596 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms