Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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SHROOM2Q13796 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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SHROOM2Q13796 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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SHROOM2Q13796 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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SHROOM2Q13796 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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SHROOM2Q13796 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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SHROOM2Q13796 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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SHROOM2Q13796 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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SHROOM2Q13796 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
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SHROOM2Q13796 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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