Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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