Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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