Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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TUBB3Q13509 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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TUBB3Q13509 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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