Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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