Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms