Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms