Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms