Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXM1Q08050 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXM1Q08050 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FOXM1Q08050 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXM1Q08050 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.05■□□□□ 0
FOXM1Q08050 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXM1Q08050 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FOXM1Q08050 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXM1Q08050 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXM1Q08050 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FOXM1Q08050 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.05■□□□□ 0
FOXM1Q08050 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXM1Q08050 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FOXM1Q08050 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXM1Q08050 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms