Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms