Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms