Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms