Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms