Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL1Q00532 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL1Q00532 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL1Q00532 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL1Q00532 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL1Q00532 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL1Q00532 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL1Q00532 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL1Q00532 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL1Q00532 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL1Q00532 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKL1Q00532 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKL1Q00532 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL1Q00532 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL1Q00532 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms