Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms