Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCDC1P59894 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCDC1P59894 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms