Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms