Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms