Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HK3P52790 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HK3P52790 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HK3P52790 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HK3P52790 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HK3P52790 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HK3P52790 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HK3P52790 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HK3P52790 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HK3P52790 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HK3P52790 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HK3P52790 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HK3P52790 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HK3P52790 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HK3P52790 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HK3P52790 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms