Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC3P51654 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC3P51654 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms