Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB28P51157 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB28P51157 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB28P51157 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB28P51157 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms