Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT8P50990 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms