Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CENPFP49454 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CENPFP49454 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CENPFP49454 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPFP49454 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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CENPFP49454 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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CENPFP49454 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CENPFP49454 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPFP49454 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CENPFP49454 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPFP49454 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPFP49454 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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CENPFP49454 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CENPFP49454 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CENPFP49454 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CENPFP49454 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPFP49454 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPFP49454 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPFP49454 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPFP49454 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPFP49454 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPFP49454 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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CENPFP49454 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPFP49454 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPFP49454 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPFP49454 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPFP49454 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPFP49454 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPFP49454 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPFP49454 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPFP49454 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPFP49454 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPFP49454 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPFP49454 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPFP49454 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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