Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GJA8P48165 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA8P48165 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA8P48165 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms