Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms