Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms