Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.3 ms