Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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PTPRMP28827 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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PTPRMP28827 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
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PTPRMP28827 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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PTPRMP28827 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
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