Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms