Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NFKBIAP25963 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms