Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms