Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPREP23469 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPREP23469 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPREP23469 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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