Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms