Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NELFEP18615 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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