Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJA1P17302 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GJA1P17302 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms