Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF3P15923 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF3P15923 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF3P15923 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF3P15923 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF3P15923 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF3P15923 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF3P15923 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF3P15923 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCF3P15923 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TCF3P15923 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms