Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BRAFP15056 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRAFP15056 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRAFP15056 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRAFP15056 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRAFP15056 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRAFP15056 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRAFP15056 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRAFP15056 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRAFP15056 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRAFP15056 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms