Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms