Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGTAO43765 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGTAO43765 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGTAO43765 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGTAO43765 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGTAO43765 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGTAO43765 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGTAO43765 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SGTAO43765 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGTAO43765 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGTAO43765 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGTAO43765 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGTAO43765 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGTAO43765 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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SGTAO43765 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
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SGTAO43765 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SGTAO43765 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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