Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR3O43731 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms