Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD6O43541 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD6O43541 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms