Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

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Length 846 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLOCKO15516 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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