Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIEO00221 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms