Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E5RI56 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E5RI56 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E5RI56 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E5RI56 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E5RI56 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E5RI56 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E5RI56 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E5RI56 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E5RI56 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E5RI56 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E5RI56 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E5RI56 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E5RI56 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E5RI56 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E5RI56 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E5RI56 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E5RI56 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms