Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 DERL3-203ENST00000404056 3113 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 LINC02133-202ENST00000569726 2626 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms