Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms